A régi időkben, létezett egy bakugan törzs, amelyet 'Sötét Bakuganok"nak hívtak. Ezek a bakuganok átkerültek egy másik dimenzióba, amikor Vestroia magjai szétosztódott. Az idők során ez a törzs Gundaliaról is eltűnt, mára csak egyetlen tagja maradt fenn, Darkus Linehalt, aki nem sokkal ezután Ren Krawler partnere lett. A furcsa az, hogy senki sem tudja mi a tiltott erejük, pedig már évszázadok óta élnek együtt Ren és családja a sötét bakuganokkal, még a sötét bakuganok se tudják. Ismeretlen, hogy milyen eleme lehet a sötét bakuganoknak. Eddig csak az ismert, hogy Darkus mindenképpen.

Ren küldetése is hozzájuk kapcsolódik:

Ren kapott egy esélyt, hogy megtarthassa Linehaltot, ha segíti a Földre menő Gundalianokat. Ren csak amiatt csinálja mindezt, hogy szabadok legyenek lent a mélyben, ahol Linehalt és Ren született. A küldetés lényege az volt, hogy toborozzanak gyerekeket Neathia ellen, és hogy az elemet megszerezzék, a nagyapjától kapott feladata, hogy Linehalt tiltott erejét megfékezze.

Tiltott Erő: Nagyon erőteljes erő, amely akár egy univerzumot is képes megsemmisíteni. Linehalt először a 25. részben alkalmazza, azonban mikor elveszti az irányítást, majdnem elpusztul Neathia. Azonban nem csak megsemmisítő, hanem gyógyító ereje is van. A 39. részben használta Linehalt, és begyógyította Neathia természeti sebeit.

Talán, a Mechtanium Surgeben szereplő káosz bakuiganoknak némi közük van a sötét bakuganokhoz, amelyeket Mag Mel használ, és ad a szolgálóinak. Ezek a káosz bakuganok úgy tűnik nem rendelkeznek értelemmel, és mindegyiken megtalálható Razenoid feje. Mag Mel börtönében lévő tojásokból kelnek ki.

Tagjai:
- Cyclone Percival(Darkus, Pyrus, Haos, Subterra, Aquos, Ventus, Combat)
- Flash Ingram(Darkus, Pyrus, Subterra, Aquos, Ventus, Haos, Combat)
- Iron Dragonoid(Darkus, Pyrus, Haos, Subterra, Aquos, Ventus, Combat)